Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYCNQ0VAF6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms