Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL2Q08999 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL2Q08999 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms