Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms