Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN1Q04323 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN1Q04323 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms