Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC4Q03721 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms