Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 KTR2YKR061W 1278 nt5.36□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 IOC4YMR044W 1428 nt5.36□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 NEM1YHR004C 1341 nt5.35□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 TFA2YKR062W 987 nt5.35□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SPO20YMR017W 1194 nt5.35□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 VHC1YBR235W 3363 nt5.35□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 ARX1YDR101C 1782 nt5.34□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 CTT1YGR088W 1689 nt5.34□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SYP1YCR030C 2613 nt5.34□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 ASF2YDL197C 1578 nt5.34□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 MDM34YGL219C 1380 nt5.34□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 ARI1YGL157W 1044 nt5.34□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 ZRT1YGL255W 1131 nt5.34□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 GRS1YBR121C 2004 nt5.34□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 BRE2YLR015W 1518 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 PDR15YDR406W 4590 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 CUE2YKL090W 1332 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 AI3Q0060 1248 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 FAU1YER183C 636 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 PRS1YKL181W 1284 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 VPS68YOL129W 555 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 DCI1YOR180C 816 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 ISU2YOR226C 471 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 BTS1YPL069C 1008 nt5.33□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 TYR1YBR166C 1359 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 RAD7YJR052W 1698 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 RKM3YBR030W 1659 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 OAF1YAL051W 3144 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YDL158CYDL158C 309 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 NSG1YHR133C 876 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 CPR3YML078W 549 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 SHE3YBR130C 1278 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 MGR3YMR115W 1506 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 BBC1YJL020C 3474 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 HSP82YPL240C 2130 nt5.32□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 PDI1YCL043C 1569 nt5.31□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 RML2YEL050C 1182 nt5.31□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YGR283CYGR283C 1026 nt5.31□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YOL166CYOL166C 339 nt5.31□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 CKB2YOR039W 777 nt5.31□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 ETT1YOR051C 1239 nt5.31□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 AVT1YJR001W 1809 nt5.31□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 MIH1YMR036C 1665 nt5.31□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 TUB2YFL037W 1374 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YMR196WYMR196W 3267 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 RPT2YDL007W 1314 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 CDC9YDL164C 2268 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 KAR5YMR065W 1515 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YFR045WYFR045W 930 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 NPY1YGL067W 1155 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YGR168CYGR168C 1131 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 PUS6YGR169C 1215 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 FUN19YAL034C 1242 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 HRT3YLR097C 1035 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 ERD2YBL040C 660 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 SLX1YBR228W 915 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 SIF2YBR103W 1608 nt5.3□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 PUF2YPR042C 3228 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 RCM1YNL022C 1473 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 NAM9YNL137C 1461 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YHB1YGR234W 1200 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YAE1YJR067C 426 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YML090WYML090W 387 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YMR178WYMR178W 825 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 RNA1YMR235C 1224 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 ATG8YBL078C 354 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 VPS21YOR089C 633 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 TOM5YPR133W-A 153 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 EFM2YBR271W 1260 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 BIT2YBR270C 1638 nt5.29□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 DRN1YGR093W 1524 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 RRI1YDL216C 1323 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 PTC1YDL006W 846 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YDR124WYDR124W 975 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YPR1YDR368W 939 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 YIL089WYIL089W 618 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 SFK1YKL051W 1062 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 ELF1YKL160W 438 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 SEC65YML105C 822 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 SCW10YMR305C 1170 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 TGS1YPL157W 948 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 FUI1YBL042C 1920 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 PFK1YGR240C 2964 nt5.28□□□□□ -1.56
CEF1Q03654 snR63snR63 255 nt5.27□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 PIB1YDR313C 861 nt5.27□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 POP6YGR030C 477 nt5.27□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 PPE1YHR075C 1203 nt5.27□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 SAW1YAL027W 786 nt5.27□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YLR049CYLR049C 1287 nt5.27□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YNL134CYNL134C 1131 nt5.27□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 BUD16YEL029C 939 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 RPF2YKR081C 1035 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 YNR042WYNR042W 429 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 RPN8YOR261C 1017 nt5.26□□□□□ -1.57
CEF1Q03654 INA17YPL099C 549 nt5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.4 ms