Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms