Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN2Q02246 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms