Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A2Q02221 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms