Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms