Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKL1Q00532 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms