Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK3Q00526 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK3Q00526 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms