Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD3P84022 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms