Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX1P83916 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX1P83916 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX1P83916 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX1P83916 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX1P83916 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX1P83916 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX1P83916 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX1P83916 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX1P83916 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX1P83916 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX1P83916 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX1P83916 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX1P83916 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX1P83916 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX1P83916 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX1P83916 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX1P83916 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX1P83916 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX1P83916 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX1P83916 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX1P83916 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX1P83916 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX1P83916 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX1P83916 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX1P83916 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX1P83916 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX1P83916 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX1P83916 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX1P83916 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX1P83916 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX1P83916 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX1P83916 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX1P83916 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX1P83916 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX1P83916 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX1P83916 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX1P83916 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX1P83916 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX1P83916 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX1P83916 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX1P83916 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX1P83916 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX1P83916 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX1P83916 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX1P83916 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms