Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN10P78369 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN10P78369 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms