Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2P78314 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms