Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS28P62857 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS28P62857 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS28P62857 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS28P62857 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPS28P62857 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS28P62857 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RPS28P62857 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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