Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23AP62750 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms