Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPFP62306 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPFP62306 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms