Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms