Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF3P61204 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF3P61204 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF3P61204 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF3P61204 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARF3P61204 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF3P61204 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF3P61204 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF3P61204 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms