Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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