Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBEYP58557 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBEYP58557 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBEYP58557 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBEYP58557 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBEYP58557 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YBEYP58557 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBEYP58557 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBEYP58557 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBEYP58557 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBEYP58557 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
YBEYP58557 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBEYP58557 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBEYP58557 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBEYP58557 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBEYP58557 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBEYP58557 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBEYP58557 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBEYP58557 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBEYP58557 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBEYP58557 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
YBEYP58557 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBEYP58557 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms