Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX4P57082 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX4P57082 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX4P57082 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX4P57082 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX4P57082 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TBX4P57082 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBX4P57082 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TBX4P57082 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX4P57082 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX4P57082 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX4P57082 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX4P57082 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX4P57082 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX4P57082 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBX4P57082 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBX4P57082 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBX4P57082 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBX4P57082 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBX4P57082 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBX4P57082 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms