Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIPK4P57078 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RIPK4P57078 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms