Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSWP56202 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTSWP56202 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTSWP56202 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTSWP56202 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTSWP56202 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTSWP56202 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTSWP56202 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTSWP56202 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTSWP56202 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTSWP56202 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTSWP56202 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTSWP56202 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTSWP56202 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSWP56202 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTSWP56202 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSWP56202 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSWP56202 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSWP56202 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSWP56202 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSWP56202 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSWP56202 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSWP56202 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTSWP56202 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTSWP56202 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTSWP56202 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTSWP56202 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTSWP56202 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTSWP56202 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTSWP56202 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSWP56202 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTSWP56202 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms