Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52P55327 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52P55327 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPD52P55327 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52P55327 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52P55327 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52P55327 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52P55327 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52P55327 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52P55327 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52P55327 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52P55327 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52P55327 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52P55327 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52P55327 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52P55327 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52P55327 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52P55327 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52P55327 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms