Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L1P55209 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms