Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3083 ms