Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms