Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LIMK2P53671 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms