Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFNA5P52803 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNA5P52803 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNA5P52803 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms