Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNHP51946 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNHP51946 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNHP51946 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNHP51946 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNHP51946 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNHP51946 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNHP51946 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNHP51946 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNHP51946 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNHP51946 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNHP51946 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNHP51946 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNHP51946 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNHP51946 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNHP51946 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNHP51946 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNHP51946 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNHP51946 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNHP51946 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNHP51946 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNHP51946 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNHP51946 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNHP51946 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNHP51946 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNHP51946 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNHP51946 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNHP51946 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNHP51946 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNHP51946 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNHP51946 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNHP51946 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNHP51946 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNHP51946 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNHP51946 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNHP51946 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNHP51946 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms