Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAMP7P51809 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP7P51809 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms