Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC3P51654 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC3P51654 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC3P51654 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC3P51654 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC3P51654 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC3P51654 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC3P51654 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC3P51654 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC3P51654 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC3P51654 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC3P51654 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC3P51654 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC3P51654 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC3P51654 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC3P51654 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC3P51654 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC3P51654 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC3P51654 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC3P51654 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC3P51654 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC3P51654 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC3P51654 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC3P51654 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC3P51654 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC3P51654 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC3P51654 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC3P51654 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC3P51654 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC3P51654 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC3P51654 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC3P51654 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC3P51654 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC3P51654 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC3P51654 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC3P51654 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC3P51654 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC3P51654 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC3P51654 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC3P51654 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC3P51654 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC3P51654 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC3P51654 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC3P51654 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC3P51654 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC3P51654 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC3P51654 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC3P51654 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms