Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF6P49848 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF6P49848 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF6P49848 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF6P49848 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF6P49848 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF6P49848 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF6P49848 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF6P49848 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF6P49848 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF6P49848 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF6P49848 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF6P49848 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF6P49848 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF6P49848 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF6P49848 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF6P49848 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF6P49848 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF6P49848 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAF6P49848 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAF6P49848 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF6P49848 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms