Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms