Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
NESP48681 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
NESP48681 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NESP48681 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NESP48681 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NESP48681 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NESP48681 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NESP48681 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NESP48681 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NESP48681 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NESP48681 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
NESP48681 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
NESP48681 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
NESP48681 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NESP48681 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
NESP48681 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NESP48681 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NESP48681 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NESP48681 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
NESP48681 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NESP48681 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NESP48681 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NESP48681 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
NESP48681 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NESP48681 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NESP48681 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NESP48681 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NESP48681 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NESP48681 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NESP48681 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NESP48681 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NESP48681 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NESP48681 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NESP48681 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NESP48681 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NESP48681 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NESP48681 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NESP48681 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NESP48681 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
NESP48681 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NESP48681 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NESP48681 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NESP48681 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NESP48681 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NESP48681 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NESP48681 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NESP48681 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NESP48681 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NESP48681 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NESP48681 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NESP48681 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NESP48681 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
NESP48681 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NESP48681 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NESP48681 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NESP48681 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NESP48681 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NESP48681 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NESP48681 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NESP48681 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NESP48681 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NESP48681 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NESP48681 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NESP48681 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NESP48681 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NESP48681 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NESP48681 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NESP48681 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NESP48681 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NESP48681 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NESP48681 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NESP48681 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
NESP48681 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NESP48681 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NESP48681 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NESP48681 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms