Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF4P48230 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms