Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN1BP46527 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms