Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR4P46093 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR4P46093 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPR4P46093 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPR4P46093 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms