Protein–RNA interactions for Protein: P46089

GPR3, G-protein coupled receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR3P46089 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR3P46089 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR3P46089 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR3P46089 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR3P46089 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR3P46089 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR3P46089 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR3P46089 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPR3P46089 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR3P46089 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR3P46089 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPR3P46089 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms