Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RANGAP1P46060 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RANGAP1P46060 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms