Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT3P45378 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms