Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms