Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL35P42766 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL35P42766 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL35P42766 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL35P42766 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL35P42766 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL35P42766 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL35P42766 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL35P42766 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL35P42766 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL35P42766 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL35P42766 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms