Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NCAPD3P42695 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC40.2■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
NCAPD3P42695 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms