Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMPOP42166 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMPOP42166 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMPOP42166 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMPOP42166 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMPOP42166 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMPOP42166 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMPOP42166 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMPOP42166 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMPOP42166 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMPOP42166 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMPOP42166 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMPOP42166 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMPOP42166 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMPOP42166 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMPOP42166 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMPOP42166 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMPOP42166 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMPOP42166 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMPOP42166 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMPOP42166 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMPOP42166 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMPOP42166 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMPOP42166 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMPOP42166 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMPOP42166 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMPOP42166 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMPOP42166 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TMPOP42166 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TMPOP42166 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms