Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPHP41219 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPHP41219 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPHP41219 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPHP41219 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPHP41219 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPHP41219 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPHP41219 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPHP41219 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPHP41219 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPHP41219 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPHP41219 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPHP41219 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPHP41219 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPHP41219 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPHP41219 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPHP41219 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPHP41219 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPHP41219 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPHP41219 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPHP41219 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPHP41219 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPHP41219 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPHP41219 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPHP41219 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPHP41219 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPHP41219 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPHP41219 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPHP41219 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPHP41219 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPHP41219 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPHP41219 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPHP41219 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms