Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP12P39900 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP12P39900 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP12P39900 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP12P39900 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP12P39900 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP12P39900 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP12P39900 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP12P39900 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP12P39900 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP12P39900 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP12P39900 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP12P39900 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP12P39900 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP12P39900 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP12P39900 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP12P39900 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP12P39900 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP12P39900 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP12P39900 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP12P39900 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP12P39900 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP12P39900 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms